Indice de diversité de Simpson

La Terre abrite un nombre considérable d'espèces différentes, dont de nombreux animaux, plantes et bactéries. En fait, en 2022, les estimations montrent qu'il y a environ 8,7 millions d'espèces différentes vivant actuellement sur Terre, dont seule une fraction (environ 1,2 million) a été découverte. Les mammifères, y compris les humains(Homo sapiens), représentent plus de 5 400 de ces espèces documentées, aux côtés d'environ 6 000 espèces d'amphibiens, 10 000 espèces d'oiseaux, plus de 10 000 espèces de reptiles et environ 25 000 espèces de poissons. Les insectes détiennent le plus grand nombre d'espèces actuellement reconnues, soit plus d'un million.

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    Les zones tropicales proches de l'équateur ont tendance à présenter une plus grande diversité d'espèces que les régions tempérées situées plus au nord et au sud, ce que l'on appelle le gradient latitudinal de diversité (LDG)(Fig. 1).

    Les forêts tropicales humides présentent le plus haut niveau de diversité (environ 90 % des espèces existantes), la forêt amazonienne détenant les niveaux les plus élevés. Les zones comme l'Amazonie sont connues comme des points chauds de la biodiversité, en raison de leur diversité et de l'abondance des espèces endémiques qu'elles abritent.

    Indice de diversité de Simpson Une carte de la biodiversité de la Terre, le rouge/orange indiquant les zones de plus grande biodiversité et le bleu/vert les zones de plus faible biodiversité. Étudier plus intelligemment

    Figure 1 : Carte de la biodiversité de la Terre, le rouge/orange indiquant les zones où la biodiversité est la plus élevée et le bleu/vert les zones où elle est la plus faible. Comme tu peux le voir, les tropiques ont des niveaux de diversité plus élevés que les régions situées plus au nord et au sud. Source : Mannion 2014

    Définition de l'indice de diversité de Simpson

    L'indice de diversité de Simpson a été créé par Edward Hugh Simpson, un scientifique anglais, en 1949. Il est important de noter qu'il est différent de l'indice de similarité de Simpson, fondé par le scientifique américain George Gaylord Simpson en 1960. En écologie, l'indice de diversité de Simpson est utilisé pour mesurer le niveau de biodiversité d'une zone donnée. Plus précisément, il s'intéresse à la diversité des espèces présentes. Pour la déterminer, l'indice de diversité de Simpson prend en compte deux facteurs : la richesse et la régularité.

    Biodiversité: La diversité de tous les organismes vivants présents dans une certaine zone. La biodiversité comprend la diversité des espèces, la diversité génétique et la diversité des écosystèmes.

    Gradient latitudinal de diversité(LDG) : Le LDG fait référence à l'augmentation progressive des niveaux de biodiversité des pôles de la Terre vers les tropiques.

    Richesse d'un écosystème

    La richesse en espèces fait référence au nombre total d'espèces présentes dans un écosystème. Plus il y a d'espèces dans un écosystème, plus le niveau de richesse est élevé. La mesure de la richesse seule ne permet pas de prendre en compte l'abondance relative des espèces. Pour la mesurer, il faut s'intéresser à la régularité des espèces.

    Exemple de richesse dans un écosystème

    Un bon exemple de richesse en espèces est l'écosystème le plus riche en biodiversité de la planète : la forêt amazonienne. L'Amazonie abrite une très grande quantité d'espèces vivantes dans le monde, dont un tiers de toutes les espèces d'arbres tropicaux. L'Amazonie abrite plus de trois millions d'espèces différentes d'organismes, dont 1300 espèces d'oiseaux, plus de 400 espèces de mammifères, près de 400 espèces de reptiles, plus de 2500 espèces d'arbres et, selon les prévisions, plus de 2,5 millions d'espèces d'insectes, dont beaucoup n'ont pas encore été découvertes. Comme la plupart des sites les plus riches en biodiversité du monde, l'Amazonie est gravement menacée par la destruction de l'habitat, qui a considérablement augmenté ces dernières années.

    L'équilibre dans un écosystème

    La régularité des espèces fait référence à la taille relative de la population de chaque espèce présente dans un écosystème. Il est important de mesurer la régularité, car un écosystème dominé de façon écrasante par une seule espèce ou un petit nombre d'espèces présente une diversité bien moindre qu'un écosystème réparti de façon plus équilibrée entre de nombreuses espèces différentes.

    Exemple de péréquation dans un écosystème

    Le Pantanal brésilien, par exemple, est un écosystème très diversifié avec de nombreuses espèces et un niveau élevé de biodiversité. Cependant, l'écosystème présente une abondance écrasante de deux grandes espèces de vertébrés - le caïman yacare(Caiman yacare), dont le nombre est estimé à près de 10 millions (Fig. 2), et le capybara(Hydrochoerus hydrochaeris).

    Dans le cas du caïman yacare, cette domination écrasante empêche les autres espèces de crocodiliens de prendre pied de façon significative dans l'écosystème du Pantanal, la seule autre espèce proche étant le caïman nain de Cuvier(Paleosuchus palpebrosus), qui est relégué en marge du Pantanal en nombre relativement faible, en raison de la domination du caïman yacare dans la région. Cela contraste avec l'Amazonie, qui abrite cinq des six espèces de caïmans existantes, et parfois quatre espèces dans une même zone d'habitat !

    Indice de diversité de Simpson Le caïman yacare domine de façon écrasante l'écosystème du Pantanal, rendant pratiquement impossible la coexistence de toute autre espèce de caïman.  Étudier plus intelligemment

    Figure 2 : Le caïman yacare domine de façon écrasante l'écosystème du Pantanal, rendant pratiquement impossible la coexistence de toute autre espèce de caïman. Source : Brandon Sideleau, travail personnel

    Formule de l'indice de diversité de Simpson

    Pour déterminer la diversité d'une zone, nous devons utiliser l'une des équations associées à l'indice de diversité de Simpson. Dans l'équation suivante, "N" indique le nombre total d'organismes, "n" la population de chaque espèce et "D" l'indice de diversité de la zone (un chiffre plus élevé indique un écosystème plus diversifié).

    \[D = \frac{\sum{n_i(n_i-1)}}{N(N-1)}\]

    Exemple d'indice de diversité de Simpson

    À l'aide de l'équation ci-dessus, nous allons déterminer l'indice de diversité de chacun de ces écosystèmes et déterminer quelle zone présente le niveau de diversité le plus élevé. Suis les instructions et essaie de trouver les réponses par toi-même.

    Écosystème A (rivière Adélaïde)

    Espècesnn-1n (n-1)
    Wallaby agile5000499924995000
    Barramundi40000399991599960000
    Cigogne à cou noir500499249500
    Requin taureau750749561750
    Crocodile d'eau salée300029998997000
    Total49250492451634763250

    Ecosystème B (zones humides du Pantanal)

    Espècesnn-1n (n-1)
    Capybara1000000999999999999000000
    Tamanoir géant25024962250
    Loutre de rivière géante500499249500
    Jaguar4000399915996000
    Cerf des marais10000999999990000
    Ocelot500499249500
    Caïman de Yacare1000000999999999999000000
    Total20152502000114547250

    Ecosystème A (rivière Adélaïde)

    \[D = \frac{24995000+1599960000+249500+561750+8997000}{49250(49250-1)} = \frac{1634763250}{2425316250} = 0,67\]

    Écosystème B (zones humides du Pantanal)

    \[D = \frac{999999000000+62250+249500+15996000+99990000+249500 +999999000000}{2015250(2015250-1)} = \frac{2000114547250}{4061230547250} = 0,49\]

    Comme tu peux le voir, l'indice de diversité de la rivière Adélaïde est de 0,67, alors qu'il est de 0,49 pour les zones humides du Pantanal, ces dernières ont donc un niveau de diversité inférieur à celui de la rivière Adélaïde.

    L'indice de diversité de Shannon

    L'indice de diversité de Shannon, également connu sous le nom d'indice de Shannon-Wiener, est une autre façon de mesurer la biodiversité d'une zone. Cet indice utilise la formule de l'entropie créée par Claude Shannon et l'utilise dans le contexte de la biodiversité. Comme l'indice de diversité de Simpson, l'indice de diversité de Shannon tient compte à la fois de la richesse et de la régularité des espèces. L'indice est noté"H" et utilise l'équation suivante, où Pi indique la proportion de chaque espèce :

    \[H = -\sum{[p_i \cdot \ln(p_i)]}\].

    Pour déterminer "H", nous devons suivre les étapes suivantes :

    1.) Détermine la somme de tous les organismes de l'échantillon.

    2.) Détermine la proportion que chaque espèce occupe par rapport à la population totale d'organismes (Pi).

    3.) Pour chaque "Pi", multiplie par ln(Pi).

    4.) Détermine la somme de tous les résultats, qui est ton "H".

    Entropie: Une façon de mesurer le désordre et l'imprévisibilité, de l'ordre au désordre. Dans les écosystèmes, l'entropie entraîne la dégradation de l'ordre et de l'organisation. L'ordre et l'organisation ne peuvent être maintenus qu'en éliminant le désordre de l'écosystème.

    Exemple

    Écosystème (fleuve Zambèze)

    EspècesnPiln(Pi) - Pi
    Eléphant d'Afrique400.05-0.15
    Lion d'Afrique250.03-0.11
    Mamba noir1000.11-0.24
    Hippopotame2000.23-0.34
    Crocodile du Nil5000.57-0.32
    Rhinocéros blanc 50.01-0.05
    Total870-1.21

    Notre "H" (indice de diversité de Shannon) est donc de 1,21.

    Lequel est le meilleur ? L'indice de diversité de Simpson ou l'indice de diversité de Shannon ?

    Les deux indices ont leur utilité et peuvent être aussi importants l'un que l'autre, selon les circonstances. L'indice de diversité de Simpson a tendance à mettre davantage l'accent sur la régularité, alors que l'indice de diversité de Shannon se préoccupe davantage de la richesse des espèces. Ainsi, l'indice de diversité de Simpson accorde une plus grande valeur à la dominance des espèces que l'indice de diversité de Shannon.

    Indice de diversité de Simpson - Principaux enseignements

    • L'indice de diversité de Simpson est utilisé pour mesurer le niveau de biodiversité d'une zone donnée. Il s'intéresse à la diversité des espèces présentes.
    • L'indice de diversité de Simpson prend en compte deux facteurs : la richesse et la régularité.
    • La richesse des espèces fait référence au nombre total d'espèces présentes dans un écosystème.
    • L'homogénéité des espèces fait référence à la taille relative de la population de chaque espèce présente dans un écosystème.
    Questions fréquemment posées en Indice de diversité de Simpson
    Qu'est-ce que l'indice de diversité de Simpson?
    L'indice de diversité de Simpson est une mesure de la biodiversité. Il calcule la probabilité que deux individus choisis au hasard appartiennent à la même espèce.
    Comment calcule-t-on l'indice de diversité de Simpson?
    Pour calculer l'indice de diversité de Simpson, utilisez la formule D = 1 - Σ(n/N)^2, où n est le nombre d'individus d'une espèce et N le nombre total d'individus.
    Pourquoi l'indice de Simpson est-il important?
    L'indice de Simpson est important car il évalue la biodiversité d'un écosystème. Une valeur élevée indique une grande diversité, signe d'un écosystème en bonne santé.
    Quelle est la différence entre les indices de Simpson et de Shannon?
    L'indice de Simpson mesure la dominance des espèces tandis que l'indice de Shannon tient également compte de leur rareté et de leur abondance relative.

    Teste tes connaissances avec des questions à choix multiples

    Selon les estimations, il y a environ __________ espèces différentes qui vivent actuellement sur Terre.

    Environ _________ des espèces vivantes ont été découvertes.

    Les régions plus proches de l'équateur ont tendance à avoir une _________ diversité d'espèces que les régions tempérées plus au nord et au sud.

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