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Sondes ADN
Lessondes ADN sont de courts morceaux d'ADN simple brin marqués pour être facilement identifiés. Les sondes peuvent être conçues pour être complémentaires d'un allèle ou d'une mutation spécifique afin qu'elles puissent se lier spécifiquement à ces séquences.
Deux types de sondes ADN sont couramment utilisés. Ce sont :
- Les sondesmarquées par radioactivité: Ces sondes contiennent des nucléotides radioactifs avec un isotope radioactif du phosphore(32P). Cette propriété confère à la sonde des caractéristiques radioactives et lui permet d'être facilement identifiable lorsqu'elle est exposée à un film radiographique.
- Sondes marquées par fluorescence: Elles possèdent des propriétés fluorescentes qui leur permettent d'émettre de la lumière et de briller lorsqu'elles sont placées dans des conditions spécifiques.
Hybridation de l'ADN Niveau A Biologie
L'hybridation de l'ADN décrit la combinaison d'une section d'ADN avec un morceau d'ADN simple brin qui contient des séquences complémentaires.
L'hybridationADN-ARN décrit la combinaison d'une section d'ARN avec un morceau d'ADN simple brin qui contient des séquences complémentaires.
Dans le contexte de cet article, le morceau d'ADN simple brin est la sonde ADN, et la section d'ADN ou d'ARN est un allèle particulier.
Une variante d'un gène est appelée un allèle.
Pour que la sonde se lie à la séquence complémentaire de l'allèle spécifique, l'ADN double brin doit être séparé. Le chauffage de l'échantillon d'ADN dénature les molécules d'ADN et sépare les deux brins en rompant les liaisons hydrogène entre eux.
Les brins d'ADN séparés sont ensuite mélangés aux sondes et la température est abaissée, ce qui permet aux liaisons hydrogène de se former (recuit) entre les brins d'ADN complémentaires. Bien que la plupart des brins d'ADN s'apparient à leur brin complémentaire d'origine, certains brins se lient aux sondes. Ce processus de liaison est appelé hybridation de l'ADN.
Technique d'hybridation de l'ADN
Les sondes ADN et l'hybridation de l'ADN peuvent être utilisées pour localiser un allèle spécifique. Ce processus comporte plusieurs étapes :
- La séquence de la base nucléotidique du gène d'intérêt doit être déterminée. Séquence l'ADN ou réfère-toi à des bibliothèques génétiques pour obtenir la séquence de la mutation d'intérêt.
- On produit ensuite un fragment d'ADN avec des séquences complémentaires à l'allèle particulier qui nous intéresse.
- Des copies multiples du fragment d'ADN sont produites à l'aide de la réaction en chaîne de la polymérase (PCR).
- Les fragments d'ADN produits doivent être marqués en ajoutant des radionucléotides (nucléotides contenant du 32P) ou des nucléotides triphosphates fluorescents au mélange PCR pour créer respectivement des sondes ADN radioactives ou fluorescentes.
- Nous devons obtenir l'ADN que nous voulons analyser en extrayant l'ADN des cellules obtenues de l'individu qui nous intéresse. L'extrait est ensuite chauffé pour dénaturer et séparer les deux brins d'ADN l'un de l'autre.
- Les sondes ADN que nous avons conçues sont ensuite ajoutées à l'extrait, et la température est abaissée, ce qui permet aux séquences complémentaires de s'apparier.
- Si l'ADN extrait contient la mutation, notre sonde ADN s'y fixera probablement puisqu'elle possède des séquences de bases complémentaires.
- Toute sonde ADN non fixée est retirée du mélange.
- L'ADN hybridé sera maintenant radioactif ou fluorescent, selon le type de sonde ADN que nous avons utilisé.
- Nous pouvons utiliser un film à rayons X ou utiliser la microscopie à fluorescence pour détecter la présence de l'ADN hybridé et confirmer si la personne suspectée est porteuse de la mutation ou non.
Application de l'hybridation de l'ADN au dépistage génétique
Grâce au travail d'innombrables scientifiques à travers le monde, nous connaissons aujourd'hui l'emplacement et le type de mutations à l'origine de nombreuses maladies héréditaires. L'hybridation de l'ADN et les sondes ADN peuvent être utilisées pour dépister des maladies héréditaires spécifiques chez les individus.
Il est possible d'étudier simultanément plusieurs mutations génétiques en fixant plusieurs sondes ADN en réseau sur une lame de verre, puis en ajoutant l'ADN du donneur au réseau. Les séquences d'ADN complémentaires, si elles sont présentes, se lient alors à la sonde correspondante.
Dépistage du cancer
Le dépistage génétique permet de détecter les oncogènes (gènes qui augmentent la probabilité de développer un cancer). Il existe deux types d'oncogènes, les gènes suppresseurs de tumeurs et les proto-oncogènes.
Lesgènes suppresseurs de tumeurs codent pour des protéines qui agissent comme des pauses dans le cycle cellulaire et empêchent les cellules potentiellement cancéreuses de proliférer.
Lesproto-oncogènes codent pour des protéines qui accélèrent le cycle cellulaire et favorisent la prolifération des cellules.
Par conséquent, toute mutation qui inactive les gènes suppresseurs de tumeurs ou augmente l'activité des proto-oncogènes peut entraîner une division cellulaire incontrôlée et conduire au développement d'un cancer.
La présence de mutations dans ces proto-oncogènes peut être détectée par un dépistage génétique. Cela permettrait à la personne porteuse de la mutation de prendre une décision éclairée sur son mode de vie. Par exemple, elle pourrait diminuer le risque de développer un cancer en mangeant plus sainement et en évitant les substances mutagènes telles que la fumée de cigarette.
Lessubstances mut agènes sont des produits chimiques ou tout ce qui peut créer une mutation dans l'ADN.
Les gens peuvent également se soumettre à des examens réguliers pour détecter le cancer à un stade précoce et améliorer les chances de réussite du traitement.
Médecine personnalisée
Un autre avantage du dépistage génétique est la médecine personnalisée. Elle permet aux médecins de traiter les patients en fonction de leur génotype. Par exemple, le médicament A peut être plus efficace pour traiter une affection chez un patient, mais pas chez un autre patient dont le génotype est différent. On peut alors utiliser pour l'autre patient un autre médicament qui offre une efficacité maximale dans son traitement.
Connaître les génotypes des patients permet aux médecins et aux pharmaciens de prescrire la dose exacte d'un médicament spécifique pour produire le résultat souhaité dans le cadre du plan de traitement des patients. Cela permet d'économiser de l'argent et d'éviter les dommages inutiles et les effets secondaires que peuvent avoir certains médicaments.
Le foie contient des enzymes qui métabolisent et éliminent les médicaments tels que les analgésiques. Les niveaux de ces enzymes varient d'un individu à l'autre en fonction de leur génotype. Par conséquent, certaines personnes ayant des niveaux plus élevés d'enzymes hépatiques peuvent avoir besoin de plus d'analgésiques que d'autres. Connaître son génotype permet de prescrire des analgésiques plus sûrs et plus efficaces.
La vitamine E est connue pour réduire le risque de maladie cardiovasculaire chez les personnes diabétiques ayant un certain génotype. Cependant, la vitamine E augmente le risque de maladies cardiovasculaires chez les personnes diabétiques ayant un génotype différent. Par conséquent, connaître son génotype peut permettre de prescrire des suppléments de vitamine E de manière plus éclairée et plus sûre.
Application de l'hybridation de l'ADN au conseil génétique
Le conseil génétique est une forme particulière de travail social. Il fournit des conseils et des informations aux personnes, les aidant à prendre des décisions personnelles les concernant et concernant leurs enfants. En se basant sur les antécédents familiaux de maladies héréditaires et sur le dépistage génétique, le conseil génétique peut informer les couples sur les chances de leurs enfants d'être atteints d'une maladie.
Voici quelques informations pour te rafraîchir la mémoire ; les allèles sont généralement soit dominants, soit récessifs. Supposons qu'un individu soit hétérozygote pour l'allèle dominant (c'est-à-dire qu'il possède l'allèle dominant sur un chromosome et l'allèle récessif sur l'autre chromosome). Dans ce cas, il présentera le phénotype dominant bien qu'il soit porteur de l'allèle récessif. Ce n'est que si un individu est homozygote pour l'allèle récessif (c'est-à-dire qu'il possède l'allèle récessif sur les deux chromosomes) qu'il présentera le phénotype récessif.
Tu te souviens de la drépanocytose ? Elle est causée par une mutation du gène codant pour le polypeptide bêta-globine, une sous-unité de l'hémoglobine. L'allèle drépanocytaire muté est récessif par rapport à l'allèle bêta-globine de type sauvage. Par conséquent, un individu hétérozygote ne présentera pas les symptômes de la drépanocytose.
Cependant, si un individu hétérozygote avait une descendance avec un autre individu hétérozygote, il y aurait 25 % de chances que leur enfant soit homozygote pour l'allèle de la drépanocytose et donc qu'il soit atteint de drépanocytose. Le dépistage génétique permet d'identifier un allèle récessif muté chez les individus hétérozygotes qui présentent le phénotype dominant et sain.
Les conseillers informent les couples sur les chances de leurs enfants d'être atteints d'une maladie et leur fournissent des informations complémentaires sur les conséquences émotionnelles, psychologiques, médicales, sociales et économiques de cette maladie. Sur la base des conseils du conseiller, les couples choisissent alors d'avoir ou non des enfants.
Préoccupations éthiques liées à l'hybridation de l'ADN
Malgré les nombreux avantages du dépistage génétique, le conseil génétique soulève des considérations éthiques majeures. Les conseillers génétiques sont confrontés à un dilemme éthique courant concernant le dépistage génétique chez les patientes enceintes. Nous avons mentionné précédemment que le dépistage génétique pouvait déterminer si l'un des parents ou les deux sont porteurs d'un problème médical. D'autres tests peuvent déterminer si le fœtus présente des mutations génétiques qui entraîneront des malformations à la naissance, des handicaps mentaux ou physiques. Les conseillers peuvent être confrontés à un défi éthique s'ils savent que leurs patientes enceintes peuvent décider d'interrompre leur grossesse plutôt que de porter le fœtus à terme.
Les tests inappropriés sont un autre problème éthique qui est apparu lorsque les tests génétiques sont devenus de plus en plus courants. Il s'agit des couples qui demandent des conseils et des tests génétiques dans l'espoir d'avoir un bébé présentant les caractéristiques spécifiques qu'ils désirent. Les couples peuvent subir des tests et avorter des grossesses qui n'aboutissent pas à des enfants idéaux, ou même des grossesses qui aboutissent à un enfant du sexe opposé à celui qu'ils désiraient.
Hybridation de l'ADN - Points clés
- Les sondes ADN sont de courts morceaux d'ADN simple brin qui sont marqués pour être facilement identifiables. Les sondes peuvent être conçues pour être complémentaires d'un allèle ou d'une mutation spécifique afin de pouvoir se lier spécifiquement à ces séquences.
- Les sondes ADN sont soit marquées avec du phosphore radioactif, soit marquées avec un colorant fluorescent.
- L'hybridation de l'ADN et les sondes ADN permettent de dépister chez les individus des maladies héréditaires spécifiques ou la présence de proto-oncogènes mutants ou de gènes suppresseurs de tumeurs.
- Connaître le génotype des patients permet aux médecins de les traiter en fonction de leur génotype. Par exemple, le médicament A peut être plus efficace pour traiter une affection chez un patient, mais pas chez un autre patient dont le génotype est différent. On peut alors utiliser pour l'autre patient un autre médicament qui offre une efficacité maximale dans son traitement.
- Le conseil génétique informe les couples sur les chances de leurs enfants d'être atteints d'une maladie et fournit des informations supplémentaires sur ses conséquences émotionnelles, psychologiques, médicales, sociales et économiques. Sur la base des conseils du conseiller, les couples choisissent alors d'avoir ou non des enfants.
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